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如何用NCBI查询基因的CDS序列

878 人阅读发布时间:2025-06-05 13:32

很多小伙伴合成mRNA需要得到基因的CDS序列,今天我们一起来看下基因的CDS序列是怎么找到的。

1. 打开NCBI网站

2. 点击下列选项,找到“Gene”

21.png


3. 选中“Gene”,在搜索框中输入基因名称,下图以“Human TREM2”为例,点击“Search”

新闻图片1


4. 检索页面出现的第一个就是,如下图:

新闻图片2


5. 点击进去,进入基因详情页,可以看到有多个转录本,如下图红框圈出来的。

新闻图片3


6. 点击“reference sequence details”我们需要看下转录本的文献引用和转本的长度进行选择那个使我们所需的转录本

新闻图片4


7. 看到有2个

新闻图片5


8. 点进去看下CDS序列长度,一般是选择序列最长的,如下图选择了“NM_018965.4”
新闻图片6

 


9. 点“CDS”,就会弹出标记棕色的序列,这就是此基因的CDS序列啦

新闻图片7

 

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