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类器官crispr-cas9基因编辑及慢病毒转染实验方法

人阅读 发布时间:2023-08-25 15:20

近几年,类器官研究十分火热,在信号通路机制,药筛药敏等研究中对类器官模型需求激增,其中利用crispr-cas9基因编辑技术对类器官进行敲低或敲减来造模是个不错的实验方法,今天小爱带大家来了解crispr-cas9基因编辑技术及慢病毒转染方法。
 

crispr基因编辑技术中有三个最为重要的组成部分:crRNA、sgRNA和Cas9蛋白。crRNA与Cas9蛋白形成复合物,sgRNA指引(crRNA/cas9)复合物靶向目的DNA区域定向切割DNA,从而达到基因编辑的目的。


图1 crispr-cas9基因编辑技术示意图

 

crispr-cas9基因编辑技术大体上有三种技术路线:All in one质粒转染法,病毒转化法,RNP复合物导入法。病毒转化法是将sgRNA、crRNA和表达cas9蛋白的序列整合进病毒中,再使用病毒感染细胞。相较于质粒转染法,优点在于sgRNA、crRNA和表达cas9蛋白可以持续存在于细胞中,从而达到一个很高的基因编辑效果


图2 慢病毒转染细胞示意图

 

很多小伙伴对类器官转染方法十分好奇,类器官慢病毒转染和细胞转染大同小异,主要有以下几个问题需要注意:

 

1、类器官在进行慢病毒转染时需不需要从基质胶里解离出来?

考虑到病毒对于基质胶的穿透性及转染效率,转染时建议将类器官从基质胶中解离出来,用适当培养基重悬在孔板内进行。

 

2、类器官在进行慢病毒转染时需不需要消化成单个细胞?

类器官在进行慢病毒转染时,消化成单个细胞来转染效率比较高,建议消化成单个细胞进行感染。

 

3、类器官转染慢病毒多长时间合适?

转染时间可根据实际实验情况调整,通常是转染12-36小时,可以借鉴细胞转染时间。

 

4、类器官筛选时要不要消化成单个细胞?如果不需要消化,从胶里解离出来就行?还是在基质胶里就行?

类器官筛选不需要消化成单个细胞,在基质胶里就可以筛选,大部分的药物都可以穿透基质胶,作用到类器官上。

 

以下给大家整理了类器官转染步骤:

 

1)收集类器官并消化成单个细胞后,按2×105/孔铺到24孔板中(细胞密度可以自行摸索);
2)用含有6μg/ml polybrene(polybrene的浓度可以自行摸索)的1ml新鲜类器官培养基替换原培养基,加入适量病毒悬液,37℃孵育;
3)(对polybrene毒性敏感的细胞选作此步骤)4小时后加入1ml新鲜培养基以稀释polybrene;
4)继续培养12-36小时后,如有少量细胞贴壁,可用枪头轻柔吹打下来,混匀,将细胞培养基混悬液收集至离心管中(一般是6-8孔为一组)。300g 4℃ 富集离心5min后移去上清,添加1ml左右类器官传代培养缓冲液(abs9730)转移到1.5mlEP管,重新重悬离心;
5)观察收集到的组织体积,添加25倍组织体积的基质胶(abs9495)重悬混匀(金属冰盒或冰上操作);
6)以24孔细胞培养板为例,每孔点胶25ul组织基质胶混合物进行铺板(金属冰盒或冰上操作),将铺好的培养板放入37℃培养箱中10-15min成胶,添加500-750μl 类器官培养基(恢复室温)进行培养;
7)待类器官出现明显增殖现象(一般需要2-3天),更换含有药物的类器官培养基进行筛选(如嘌呤霉素等),没有转染成功的类器官将会裂解凋亡,从而筛出成功转染的类器官;

(* 图源网络,仅供学习参考用)

 

货号

品名

规格

abs9495

基质胶(低因子、无酚红)

1.5ml*4/ 1.5ml*8

abs9730

类器官传代培养缓冲液

250ml/ 250ml

abs9444

Organotial人肝癌类器官培养基试剂盒

1kit

abs9445

Organotial人结直肠癌类器官培养基试剂盒

1kit

abs9443

Organotial人肺癌类器官培养基试剂盒

1kit


Absin特色产品线:

WB相关:ECL发光液、预染marker、预制胶;IHC相关:二抗试剂盒、组化笔;IP/CoIP试剂盒;激动剂/抑制剂;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡试剂盒;呼吸爆发试剂盒;ELISA试剂盒;重组蛋白;抗体: 二抗、标签抗体、对照抗体;定制服务(抗体/多肽/蛋白/标记/检测)..

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