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做WB还不懂怎么选择mark?爱必信详解送上

1402 人阅读发布时间:2020-02-14 10:37

同学们做WB首先要了解你需要的蛋白mark,通常可分为:

1、未预染的Marker即宽分子量蛋白标准、高分子量蛋白标准以及低分子量蛋白标准;

2、染的Marker即单色预染和多色预染。
 

在western Blot过程中,分子量Marker往往对实验结果有着不可忽视的作用。这个Western Blot参照家族的一员的作用主要是用来指示蛋白条带所对应的分子量大小,只有标准量精确无误了,实验结果才有说服力,除此之外,蛋白标准还有表示转移成功或者蛋白在凝胶上的电泳程度等等的作用,所以选择正确的蛋白Marker也是western blot实验成功的必要条件之一。
 

一. 未染色(premixed)蛋白分子量标准

由于没有附带染料分子或者是标记分子,所示大小正好是蛋白原本的大小,所以未染色的蛋白分子量标准是最简单,也是最准确的一种。现在的marker多数都选用预混和的Marker,方便不同大小的蛋白比较。预混的Marker通常有几条带加倍浓度作为指示,因为混合的条带越多,不好辨识。所以当看到特别浓的那几条标志带就记得是哪里了。不过要记得,小带通常都不那么容易看清楚的。在选择上来说,当然是选择其中至少有一条条带和自己的目的蛋白大小相近的最好,越近越好。如果你的蛋白不幸在两条跨度较大Marker条带之间,则需选取适当跨度mark。预混的Marker使用上不如预染Marker,因为电泳过程中完全看不到,必须要结合目标蛋白方可使用,无法对实验起参照作用。


二.预染蛋白分子量标准

预染蛋白分子量是一些纯化好的蛋白混合物,通过与染料共价耦联,在电泳过程中或者转膜时可以直接观察到。预染蛋白分子量的出现方便了我们的实验,这种蛋白分子量标准可以帮助我们在电泳时、电泳后,以及转膜后监测电泳情况和估计迁移率——比如,已知垂直电泳最佳分辨区域大约在胶的2/3处,如果使用预染Marker就可以预测目标蛋白进入最佳分辨区时停止电泳以得到最佳分辨效果;如果观察到Marker电泳异常也可以及时终止电泳;另外在Western Blot转膜以后可以直接观察蛋白转膜是否完全,还可以在膜上标记蛋白分子量,所以吸引了许多实验室人员购买预染蛋白标准。值得注意的是预染蛋白Marker与染料共价耦联,所以在不同的缓冲条件下电泳时迁移特性可能会发生某些变化,可能导致一些偏差,所以不太适合精确定位蛋白——不过多数情况下Marker的条带未必能和我们的目标蛋白完全一样,我们得到的也不过是一种相对Marker指示的参考大小,最后都需要Western来定性,所以如果不是要区分大小相近的条带,预染Marker还是很好用的,而且也可以和未染色的蛋白标准一起使用。

预染蛋白标准可以分为两种:单色预染和多色预染,其实区别就在于帮助在实验过程中辨认某个条带的大小——Marker条带越多参考价值越大,可就越难辨认区分,如果用不同的颜色来区别就比较好辨认。如果沉闷的电泳实验中跑出五颜六色的彩虹Marker,单色的Marker通常是利用其中某些条带加倍浓度来提示其大小的。还有一点特别要注意,由于转膜是一个将胶里的Marker浓缩在透明膜上,所以需要的上样量相对少一些,如果想要在电泳过程中看到美丽的“彩虹”,或者单色的Marker往往需要比说明书里多加一些Marker的。

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